FMIPA sebagai salah unit/divisi penyelenggara pendidikan tinggi di Institut Pertanian Bogor yang berkomitmen dalam mengembangkan ilmu pengetahuan, teknologi, keinsinyuran, dan matematika, berupaya mempersiapkan dan menghasilkan lulusan berdaya saing dan berkualitas terbaik, yang memiliki integritas tinggi dalam menerapkan keahlian dan pengetahuannya secara profesional di bidang kerja maupun dalam memecahkan masalah sosial sebagai bentuk pengabdiannya kepada masyarakat.
FMIPA menyelenggarakan program studi Sarjana dan Pascasarjana (Magister & Doktor) yang dikelola oleh 8 departemen.
Sarjana
Program Sarjana merupakan program pendidikan akademik yang bertujuan menyiapkan mahasiswa menjadi warga negara yang beriman dan bertakwa kepada Tuhan Yang Maha Esa, berjiwa Pancasila, memiliki integritas kepribadian yang tinggi, terbuka dan tanggap terhadap perubahan dan kemajuan ilmu pengetahuan, dan masalah yang dihadapi masyarakat.
Pascasarjana
Program Pascasarjana merupakan program pendidikan akademik yang bertujuan menyiapkan mahasiswa menjadi warga negara yang beriman dan bertakwa kepada Tuhan Yang Maha Esa, berjiwa Pancasila, memiliki integritas kepribadian yang tinggi, terbuka dan tanggap terhadap perubahan dan kemajuan ilmu pengetahuan, dan masalah yang dihadapi masyarakat.